生殖系统是产生生殖细胞、繁殖后代、分泌性激素、维持副性征的器官的总称。每个生殖器官的生理功能各不相同，现分别介绍如下：
1．睾丸的生理功能
睾丸是产生雄性生殖细胞（即精子）的器官，也是产生雄性激素的主要内分泌腺。曲细精管之间有间质细胞可以分泌雄性激素，促进男性生殖器官和男性第二性征的发育及维持。曲细精管上皮细胞具有产生精子的作用，曲细精管互相结合成直细精管，是精子输送的管道系统，最后汇集、合成一条管道进入附睾头部，通过输精管排出体外。
2．附睾的生理功能
附睾有储存和排放精子、促使精子成熟和分泌液体供给精子营养作用。上述生理功能是通过附睾上皮细胞的吸收、分泌和浓缩功能来完成的。附睾管盘旋形成附睾头、体、尾，全长4～6米。精子在附睾管中一般存在9～21天。发育成熟并获能，成为活动的精子。成熟的精子储存于附睾、输精管、输精管壶腹部。射精时精子随精液排出体外。附睾可分泌少量液体，为精浆的成分之一。
3．精索、输精管及射精管的生理功能
精索是使睾丸、附睾及输精管的血液、淋巴液循环通过，也是保证睾丸的生精功能及成熟精子输送的主要途径。
输精管开口于前列腺中尿道嵴旁。尿道排尿时，射精管开口关闭；射精时开放，精液通过尿道射出。
4．精囊、前列腺和尿道球腺的生理功能
精囊为屈曲状的腺囊，其分泌液主要为精浆液，占精液的70％左右，对精子的存活有重要作用。
前列腺能分泌前列腺液，主要为精浆液，占精液的20％～28％，含有多种微量元素及多种酶类。在精阜近端，平滑肌加强，称为前列腺前括约肌，具有防止逆行射精的功能。
尿道球腺分泌液体，参与精液的组成，又有性交时润滑阴茎头的作用。精液由精子和精囊、前列腺、附睾和尿道球腺分泌的液体组成，呈乳白色，一次射精1．5～6．5毫升，含精子0．6亿～2亿个。
5．尿道的生理功能
男性尿道既有排尿功能，又有排精功能，为共用的唯一通道。
6．阴茎的生理功能
阴茎具有排尿、性交、射精三大功能。
7．阴囊的生理功能
阴囊是一个智能器官，除担当内容器官的保护作用外，还是其内容器官的温度调节器。阴囊的肉膜含有平滑肌纤维，平滑肌随外界温度呈反射性地舒缩，以调节阴囊内的温度，有利于精子的发育。如外界温度高时，平滑肌舒张；而外界温度低时则收缩。