2003年5月，据说一份有关寡头们可能酝酿政变的政治咨询报告摆在了普京面前。作为回应，在2003年6月的一个政府发布会上，克里姆林宫特别安排的第一个提问的问题就是有关“寡头革命”的。普京当时的回答是：俄罗斯决不会“允许个别商界人士为其公司利益而影响国家的政治生活”。“不同意这一原则的。”普京补充说，应该记住那些已失败的人的前车之鉴，“一些人永远地消失了，另一些人则遥不可及”。他指的是流亡海外的别列佐夫斯基与古辛斯基。
霍多尔科夫斯基决定一意孤行，在他看来，与克里姆林宫保持一致，已变成值得嘲笑的一件事。他和政治实在走得太近了，近得甚至连普通的俄罗斯人都开始怀疑，他到底是商人还是政治家。
不过普京不是叶利钦，这个前克格勃和寡头之间并没有说不清楚的关系，他甚至因为坚决反对寡头而拥有了大批选民。
对列别杰夫的被捕，《独立报》表示，一个人被戴上了手铐，感到难受的是另一个人。因为，列别杰夫是霍多尔科夫斯基控制下的尤科斯石油公司的重要股东，普京还是希望霍多尔科夫斯基能够放弃他的政治狂想。
接下来发生的事情，把两个强人都推上了对抗之路。
2003年7月4日，霍氏参加了美驻俄大使馆的独立日庆祝会。7月5日，霍氏被检察部门传唤。接着，他去美国爱达荷州参加有比尔·盖茨、沃伦·巴菲特等重量级人物在场的商业聚会。
很多人认为，霍多尔科夫斯基的这次远行，是他脱离俄罗斯的危机最好的机会，但令人惊讶的是，在美国的聚会结束后，霍氏回到了莫斯科。“我以为他会流亡，”一个俄罗斯大亨说，“但是他决心成为一个持不同政见者。”
“他不会妥协，”在英国流亡的别列佐夫斯基表示，“一些人能停止表现自我，选择虚伪；另一些人则认为自己的观点是重要的，这便是霍多尔科夫斯基。他不会让他们击垮自己。”
回到祖国的霍氏表示，他确信俄罗斯的新民主能够帮助和保护他在尤科斯的权益。他不但没有偃旗息鼓，反而借列别杰夫的被捕事件来公开批评普京政权，认为普京是在向集权时代倒退。尤科斯也在全俄各地大树“我们团结在一起”的户外广告牌，其公司网站上也出现了“狙击尤科斯”的专题讨论。
在这一年的10月中旬，霍氏约见了自己的私人律师。当时在场的律师回忆，霍氏表示知道自己将会被逮捕，并已为此做好准备。对前来采访的西方媒体，霍氏也做如是表示，并说他仍然非常年轻，非常富有，当局终有一天会释放他，在这之后，他将继续自己的“战争”。他甚至开玩笑说，自己把头发理短，就是为自己被当局抓进监狱做好准备。
直到10月25日，在被捕前最后一次接受采访时，霍氏仍保持着对普京政权的蔑视。“他们需要表明，即便是这个国家最透明的公司，也不是安全的。”
所有一切的结束用了不到五分钟。
莫斯科时间2003年10月25日凌晨五时许，一架“图134”专机降落在俄罗斯新西伯利亚市托尔马乔沃机场，准备加油，但还未停稳就被十多辆警灯闪烁的军车团团包围。这些全副武装、头戴面罩的特种部队士兵和身穿黑色制服的特工很快冲入机舱，大喊“联邦安全局，枪放地上，否则开火”！
在七寡头或流亡或沉寂的21世纪的第三个年头，他们中最后的希望，也被击碎了，霍多尔科夫斯基成为了又一个阶下囚。
在像好莱坞电影情节般地被捕后，霍多尔科夫斯基被关押到俄罗斯著名的“水兵寂静”监狱。该监狱是上世纪50年代修建的，专门用来关押重要政治犯。三天后，他被转移到条件较好的莫斯科四号监狱。俄罗斯检察官在霍氏被捕当日对他进行了审讯，随后立即把他送上了刑事法庭，要求法庭批准逮捕。对于这次逮捕的理由，检察院指出是霍多尔科夫斯基犯有诈骗、逃税、伪造公文、利用欺骗手段给别人造成财产损失、侵占财产和拒不执行法院判决等七项罪行，其中一些事项与10年前收购国有资产有关。根据国际文传电讯社的报道，莫斯科法庭判定，霍多尔科夫斯基应被监禁。而俄总检察院表示，霍多尔科夫斯基的公司及其下属机构非法攫取的资金和逃税金额总共超过10亿美元。如果对霍氏的所有指控都成立的话，他可能最多被判入狱10年。
在入狱后不久，霍多尔科夫斯基通过律师发表声明说：“我并不对我所做过的任何事感到遗憾，我也不对今天发生的事感到遗憾。”此后，接近他的人士表示，霍氏正在考虑参加明年3月的总统大选，即便是在狱中。
八天后，被羁押在监狱中的霍多尔科夫斯基表示自己将辞去总裁职务，今后也不在合并后的尤科斯—西伯利亚石油公司担任任何职务。外界认为，因涉嫌巨额逃税和欺诈等犯罪行为被羁押的霍多尔科夫斯基此举正是为了将他的案件与整个公司业务分开，以减少公司遭受的损失。而尤科斯公司组建新董事会则是为了稳定当前局势，避免公司的正常业务受到严重影响。
2003年11月11日，俄罗斯莫斯科市巴思马尼区法院作出裁决，拒绝了霍多尔科夫斯基要求保释的上诉，这意味着霍氏将按照检察院的要求，被至少拘押到12月30日。
2003年12月22日，霍多尔科夫斯基在莫斯科一个法庭出庭，接受有关对他羁押期延长问题的听证。俄总检察院又要求再把他的羁押期延长三个月。
2004年3月19日上午，莫斯科一家地方法院再次开庭，对霍多尔科夫斯基进行了将近七个小时的庭审。最后判决将霍氏羁押候审期限定为当年5月25日。
这一天，霍多尔科夫斯基依旧在做一个关于自由的梦想。在法庭上，他把自己的想法告诉了一些记者：“我相信自己没有犯罪。某些人一直在指责我干涉政治，我认为这种指责毫无道理。俄罗斯目前的经济需要什么需要政治支持。政治应该为经济建设服务。只有这样，俄罗斯的经济才能高速发展。等恢复自由后，我会一如既往地坚持自己的追求，去为社会多做些好事。”语气强硬的霍多尔科夫斯基说。这却成了他最后的强硬发言。
１０天后，俄罗斯《商业日报》刊出了一封霍氏在狱中完成的“悔过书”——《俄罗斯自由主义危机》。在这封信里，他无奈地写道：“我们应该结束怀疑总统合法性的所有行动，因为这是毫无意义的。不管我们是否喜欢弗拉基米尔·普京，我们都应该认识到俄罗斯总统不是一个普通的人，总统是保证国家统一和稳定的机制，也许是上帝阻止我们让这一体制崩溃。”
这位石油大亨甚至把过去的第一宿敌普京描述成“自由民主主义的捍卫者”，在文章中，他说：“是的，普京既不是一个自由主义者，也不是民主派，但他仍然比我们国家中70%的人口更向往自由和民主。”此种表态，被全球媒体看作是霍多尔科夫斯基自２００３年10月被捕以来首次向克里姆林宫公开妥协。
不过一切已经太晚了，以俄罗斯司法程序，一般的案件从检察机关交由法院审理，必须在50—80个工作日内对案件作出判决。霍多尔科夫斯基从2003年10月25日被捕，到2003年12月下旬法院作出延期一个审理程序，推到次年3月25日。2004年3月19日，法院再次推迟一个审理程序，延期到5月25日。这已经说明游戏将是没有时间终点的，由于参与这场政治游戏的玩方太多，牵涉到重大的国家利益，普京似乎也难以在一时准确地平衡入局各方的力量。
普京会不会考虑在完成3月总统大选后释放这个“敌人”呢答案是否定的，也许他太谨慎了。普京并没有在5月宣誓就职后释放霍氏，继续在监狱里等待审判是霍多尔科夫斯基唯一的选择。
2004年，霍多尔科夫斯基明显老去了，因为他最后的资本也开始风雨飘摇。
2004年12月19日，俄罗斯联邦财产基金会对尤科斯公司旗下最大的子公司尤甘斯克大部分股份进行公开拍卖，起拍价预定为86亿美元。名不见经传的“贝加尔金融集团”出人意料地以93.7亿美元的价格购得了尤甘斯克公司76.79％的股份。仅仅用了五分钟，霍多尔科夫斯基曾经拥有的这个挣钱机器就成了别人的产业。
12月22日，国有的俄罗斯石油公司又吞并贝加尔这个尤科斯的神秘买家，从而收购了刚刚拍得尤科斯子公司尤甘斯克76.79%股份的贝加尔金融集团公司，成为这些股份的新持有者。这使尤甘斯克最终又回到了国家的控制之中。而在这次收购后，尤甘斯克与俄天然气工业股份公司、俄石油公司并到一起，从而可跻身世界最大石油公司的行列。
也许这才是普京苦苦等待的一天。而随着大量尤科斯公司旗下子公司被拍卖或者收购，以及政府要求其偿还所欠税款，尤科斯最终的命运，似乎只有破产。
没有多少人对霍多尔科夫斯基的未来再抱有希望了，而我们的话题也要回到2005年3月，霍多尔科夫斯基被《福布斯》富豪榜认定仍旧拥有22亿美元的财产——但这又有什么用呢
在与强权的俄罗斯和普京的斗争中，他的命运已经被注定：和所有历史上的寡头一样，或者流亡，或者默默无闻老去，或者在监狱中等待一个重新审判的时刻。
倒掉的世界：俄罗斯“七大寡头”
谈到俄罗斯的富豪，永远绕不开寡头的话题，据说在寡头经济最厉害的时候，俄罗斯的七个集团曾经控制着俄罗斯85%的财富。
事实上，俄罗斯的寡头一直就是世界经济领域的一个奇观，这些“寡头”主要指在20世纪90年代俄罗斯私有化过程中一夜暴富的大资本家。1996年3月的一天，叶利钦秘密召见了七个金融寡头，他们是联合银行总裁别列佐夫斯基、大桥银行总裁古辛斯基、国际商业银行总裁维诺格拉多夫、首都储蓄银行总裁斯摩棱斯基、阿尔法银行总裁弗里德曼、梅纳捷普银行总裁霍多尔科夫斯基、俄罗斯信贷商业银行总裁马尔金。双方达成了一项协议：银行家提供财政支持，确保叶利钦连任；叶利钦则承诺维护寡头的经济利益。这就是后来的“七大寡头”。
这七个人都是头脑灵活、敢于冒险的“精英”，他们几乎都大学毕业，年龄在40—50岁之间，有的得过国家奖金，有的还是科学院通讯院士。这些人加上统一电力公司总裁丘拜斯，基本上控制了国家的油气、动力、冶金业和金融业，并在一定程度上操纵了舆论。
双方第一个回合的较量发生在1998年。这一年，俄罗斯私有化造成的不合理分配结果首次显现出来，一场金融危机伴随着通货膨胀席卷全国。时任总理的普里马科夫曾经试图对付这些经济寡头，同时要“改善国家管理”，限制寡头对政权的控制，但最后遭到罢黜。在第一个回合的较量中，寡头们占了上风。
而国家的胜利则在第二回合，这个回合的主角是普京。2000年5月，普京就任总统几个月后，便开始对经济寡头进行打击，首先拿挑战其内外政策的古辛斯基和别列佐夫斯基开刀，以洗黑钱、侵吞国家财产和诈骗罪对他们提出起诉。两人拒不出庭，逃到国外，被俄总检察院通缉。当局随后又指控波塔宁等五名财阀侵吞国家财产或偷税。
的确到了寡头们付出代价的时候了。正如普京所说：“俄罗斯有一部分人瞬间暴富，变成了亿万富翁，这是通过占有国家财富的方式实现的，他们的财富是国家赋予的，是免费赋予的。连他们自己都承认他们亿万富翁的头衔是国家任命的。”他要开始收拾这些由自己统治的这个国家任命的亿万富翁，而在这个以强势著称的俄罗斯政治领袖面前，所有的寡头都倒下了。让我们像快餐一样消费时装，消费，消费，再消费！