古巴革命胜利以后，切·格瓦拉先后被新政府委任以土地改革全国委员会工业部主任、国家银行行长和工业部长等重要领导职务，在国内外均享有盛誉。
然而，在1965年4月以后，格瓦拉秘密出走，从此退出了公众视线。人们对他的出走感到迷惑不解，学者们众说纷纭，莫衷一是。
归纳起来，对于格瓦拉出走的原因有以下四种看法。
第一，有些学者认为，迫使他出走的因素是苏联对格瓦拉政策的反对。
苏联在几个方面都不同意格瓦拉的政策：不同意格瓦拉在古巴国内推行反对物质刺激的政策；赫鲁晓夫对格瓦拉倾向中国的政策非常不满。
第二，格瓦拉在经济建设和思想建设路线上与古巴其他领导人存在着严重分歧。
新政府成立后，格瓦拉强烈要求实行严格的中央集权路线，要缔造“社会主义的新人”。可是有的人主张不要过度集中，应该给国营企业一定的自主权。两种思想引起了矛盾。
第三，格瓦拉对他主管的工业改革的失败感到极度失望。
第四，格瓦拉对于在拉丁美洲直接开展革命战争更感兴趣。格瓦拉的这一想法，是经过长期考虑的。
而且。格瓦拉的出走有明确的目的，他是怀着视死如归的决心出走的。他在临走之前写给母亲的告别信中作了如下表述：“我相信武装斗争是各族人民争取解放的唯一途径，而且我是始终不渝地坚持这一信念的。许多人会称我是冒险家，只不过是另一种类型的，是一个为宣扬真理而不惜捐躯的冒险家。也许结局就是这样，我并不寻找这样的结局，但是，这是在所难免的。如果是这样的话，我在此最后一次拥抱你们。”
在进与退之间，格瓦拉做出了自己的选择，至于做出这样选择的原因就只有他自己知道了。