鲨鱼湾地区的海湾、水港和小岛形成一个很大的生态群落。那里拥有一个庞大的水生生物世界，海龟、鲸鱼、对虾、扇贝、海蛇、鱼类和鲨鱼在这个地区都是极平常的水生生物。与此同时，在一些地区珊瑚礁、海绵和其他的无脊椎动物以及热带和亚热带鱼类也形成一个独特的生态群。宽广平坦的海滩上生活着各种各样的掘穴类的软体动物、寄居蟹和其他的无脊椎动物。但是在鲨鱼岛这个生态系统中最为基础的支撑还是“海草牧场”。
鲨鱼湾的海草平原是面积最大和种属分异度最高的区域，在其他地区，一般很大的面积内也只生长一到两种海草。例如北美洲和欧洲大的绝大多数地区只有一种海草。但在鲨鱼湾地区却有12种之多，在海湾的一些地方，每平方米内可以很容易地鉴定出9种海草。海草平原在海洋公园和科学上具有重要意义。它也是鲨鱼湾这一世界遗产的重要组成部分。鲨鱼湾内有许多浅水地区，这些地区是作为跳水和潜水活动的良好场所。古德龙残骸被西澳大利亚海运博物馆评估为最佳的残骸之一。濑鱼、叉尾霸鹟以及成群结队的蝴蝶鱼、种类繁多的热带鱼、颜色亮丽的天使鱼、懦艮和海龟等在海湾中繁衍生存。澳大利亚的海龟大多是食肉动物，一年四季在海湾中都可以见到单独出现的海龟，大规模的海龟聚集从7月底就开始了，尽管海龟的繁殖季节通常是在此之后。传统上，海龟和懦艮是其产地的土着居民餐桌上的佳肴，但在鲨鱼湾地区这两种动物并没有受到其在世界其他地区一样的生存压力。在海洋公园中，宽吻海豚这种野生动物会经常来到海岸边与人们接触，并接受人们投喂给它们的鱼。
水下最值得欣赏的景观就是那宽阔的珊瑚丛。珊瑚礁块的直径大约有500米左右，其间充斥着丰富的海洋生物，无数色彩斑斓的珊瑚争相映入人们的眼帘，蓝色、紫色、绿色、棕色等等，真是美不胜收。