扁鹊是勃海郡郑地人，姓秦，名越人。年轻时在一家客店做主管。客人长桑君到客店来，只有扁鹊把他当成一个奇人看待，时常恭敬谨慎地接待他。长桑君也知道扁鹊不是一个普通人，他来客店有十多年了，一天他招呼扁鹊和自己坐坐，悄悄对扁鹊说：“我有秘方，我老了，想要把它传给你，你不要将其泄露出去。”扁鹊说：“是。”于是长桑君从怀中掏出一种药给扁鹊，并说道：“用未落地的露水送服这种药下肚，三十天后你就能了悟许多事情。”接着又把他所有的秘方都给了扁鹊。忽然之间他就消失了，大概他不是凡人吧。扁鹊按照他所说的，服药三十天，就能看得见墙另一边的人。因此用这个功能给别人看病时，能看到五脏内所有的病变部位，只是表面上还以为病人切脉为名。他有时在齐国行医，有时是在赵国。在赵国时名为扁鹊。
晋昭公时，诸多大夫的势力强大而国君的力量衰弱，赵简子是大夫，却专断国事。赵简子生病了，五天不省人事，大夫们都感到害怕，于是把扁鹊召来。扁鹊进去诊断后走出来，董安于向他询问赵简子的病情，扁鹊答道：“他的血脉正常，你们大惊小怪什么！从前秦穆公也曾出现过这种情形，昏迷了七天后才醒。醒来当天，告诉公孙支和子舆：‘我在天帝那里非常快乐。之所以去那么久，是因为正好碰上天帝要告诉我一些事。天帝对我说“晋国将要大乱，五代不能安宁。之后将有人成为霸主，他称霸不久就会死去。霸主的儿子将使你们国家的男女淫乱”。’公孙支把这些话记录并且收藏起来，后来秦国的史书上记载的这些事就发生在晋国了。晋献公时的大乱，晋文公的称霸，及晋襄公在殽山打败秦军后，回朝便放纵淫乱，这些你都是知道的。如今你们主君的病和秦穆公的相同，不出三天就会痊愈，然后必定也会说一些话。”
过了两天半后，赵简子醒了，告诉众大夫：“我去天帝那儿后非常快乐，与百神在天的中央游玩，那里有各种乐器，奏出许多乐曲，跳着各式舞蹈，不像三代时的乐舞，乐声令人心动。有一只熊想要抓我，天帝命令我将其射杀，我射中了熊，熊死了。有一只罴过来了，我又射它，射中了，罴也死了。天帝非常开心，赐给我两个竹笥，里边都装有副品。我看见我的儿子在天帝身旁，天帝托付给我一只翟犬，并说：‘等到你儿子长大成人时赏赐给他。’天帝告诉我：‘晋国将会一代比一代衰微，过了七代就会灭亡。秦国人将在范魁之西大败周人，但他们也不能拥有那里。’董安于听完这些话后，将这些话记录并收藏了。人们将扁鹊的话告诉赵简子，赵简子赐给扁鹊四万亩田地。
后来扁鹊路经虢国。虢太子死了，扁鹊到虢国王宫门前，问一位喜好方术的中庶子道：“太子得了什么病，为什么在京城举行祭祀的事超过了其他所有的事？”中庶子说：“太子的病是血气没有按照规律运行，阴阳交会错乱而无法疏泄，猛烈地在体表发作后，就造成了内脏受到伤害。人体内的正气不能制止病邪之气，邪气积聚在体内而不能疏泄，因此阳脉弛缓阴脉迫急，所以突然昏厥至死。”扁鹊问：“他是什么时候死的？”中庶子答道：“从鸡鸣到现在。”扁鹊又问：“收殓了吗？”答道：“还没有，太子离世还不到半天。”“请禀告虢君，我是勃海郡的秦越人，家在郑地，还没有机会仰望到君王的神采，拜见并侍奉他。听说太子不幸去世了，我有办法使他复活。”中庶子说：“先生该不是在胡说吧？怎么说太子能再活过来呢！我听说上古时有个叫俞跗的医生，他治病不用汤剂、药酒、镵针、砭石、导引、按摩、药熨等方法，而是一诊视就发现疾病的所在，顺着五脏的腧穴，割开皮肤，剖开肌肉，疏通经脉，结扎筋腱，按摩脑髓，触动膏肓，疏理横膈膜，清洗肠胃，洗涤五脏，修练精气，改变形体，先生的医术若能如此，那么太子就能死而复生了；如果无法做到像那样，却想要使太子复活，简直不能把这样的话告诉刚会笑的孩子。”过了整整一天，扁鹊才仰天叹息道：“您说的那些治疗方法，就像用竹管来看天，从缝隙中观察花纹。我用的治疗方法，不必切脉、看面色、听声音、观察体态神情，就能说出疾病之所在。知道病人外在的表现，就能推知内在发病的原因；知道疾病内在的原因，就能论知它外在的症状。人体内的疾病会从体表显现出来，不需远行千里，我诊断病人的方法很多，不应只从一个角度看事物。你如果认为我不够真实可靠，你可以进去试着诊视太子，应该会听到他耳朵鸣响、看到他鼻翼翕动，顺着两腿摸到他的阴部，那里应该还有余温。”
中庶子听了扁鹊的话，目眩眼花不能眨动，舌头翘着说不出话，后来就进去把扁鹊的话禀告虢君。虢君听后非常惊讶，走出内廷到宫廷的中门接见扁鹊，对他说：“我私下听说您的高风亮节已经很长时间了，然而一直没机会拜见您。这次先生路经我们小国，若有幸得到您的救助，那我这个偏远国家的君主真是太幸运了。有先生在，我的儿子就能活过来；没有先生，他就只有被抛尸野外而填埋沟壑了，永远死去不得复活。”话没说完，他就悲伤抽泣，精神恍惚，不停流泪，悲哀得无法自制，容貌神情都变了样。扁鹊说：“太子得的病，就是所谓的‘尸蹶’。由于阳气陷入阴脉，脉气缠绕冲了胃，经脉受到损伤而脉络被阻，分别注入下焦、膀胱，所以阳脉下坠，阴气上升，阴阳两气交会，闭塞不通。阴气又逆而上行，而阳气只好在内部运行，阳气徒然在身体下部和内部鼓动却不能上升，在上、在外的阳气被阻绝而不能被阴气遣使，身体上部有隔绝了阳气的脉络，下部有破坏了阴气的枢纽，这样阴气破坏、阳气断绝，所以人的容颜失色，血脉混乱，因此人就会形体安静，像死去的样子。太子实际上并没有死。因为阳气入袭阴气阻隔了脏气的，便能治愈；阴气入袭阳气而阻绝脏气的，必定会死。这几种情形，都会在五脏厥逆的时候突然发作。医术精良的医生可以治愈这种病，拙劣的医生就会困惑了。”
扁鹊便叫他的弟子子阳磨砺针和砭石，在三阳五会穴下针。过了一会儿，太子醒过来了。扁鹊又让弟子子豹准备五分剂量的药熨，再用八减方的药剂混合煎煮，交替熨敷在两胁下面。于是太子能坐起来了。又进一步调和阴阳，仅仅口服汤剂二十天就使身体恢复得和从前一样了。因此天下人都认为扁鹊能使人死而复生。扁鹊却说：“不是我能使人死而复生啊，这是他自己能够活下去，我只是促进他恢复健康罢了。”
扁鹊路过齐国，齐桓侯将他当作客人来招待。他进入朝廷拜见桓侯时说：“您的皮肤和肌肉之间有疾病，不治恐怕会深入体内。”桓侯说：“寡人没有病。”扁鹊出去后，桓侯对身边的人说：“医生喜好功利，想把没病的人说成是自己治好的，以争功。”五天后，扁鹊再去拜见桓侯，说：“您的病已到了血脉里，不治恐怕会加重。”桓侯说：“我没病。”扁鹊出去了，桓侯不高兴。又过了五天，扁鹊再次拜见桓侯，说：“您的病已到了肠胃间，不治将更深入体内。”桓侯不搭理他。扁鹊出去后，桓侯不高兴。五天之后，扁鹊又去，看见桓侯就退出去跑了。桓侯派人问他逃跑的原因。扁鹊说：“疾病在皮肉间，靠汤剂、熨药的效力就能治病；疾病在血脉中，靠针扎、砭石的效力就能治病；疾病在肠胃中，药酒的效力就能治病；疾病到了骨髓，就是司命之神也无可奈何了。现在疾病已在骨髓中，我因此不再为他治病了。”过了五天后，桓侯身染重病，派人去召扁鹊，扁鹊已逃离了齐国。于是桓侯就病死了。
假若桓侯能预知没有显露的病的征兆，能够让好的医生及早治疗，那么疾病就能治愈，性命就可以保住。人们担忧的是生的病太多，医生担忧的是治病的方法太少。所以有六种疾病不能医治：为人骄狂放纵不讲道理，是一不可治；轻视身体看重财物，是二不可治；衣着饮食不适应时节变化，是三不可治；阴阳错乱，五脏功能不稳定，是四不可治；形体羸弱而不能服药，是五不可治；迷信巫术而不相信医术，是六不可治。有其中的一种情形，就很难医治了。
扁鹊的名声传遍天下。他路过邯郸时，听说当地人尊重妇女，就做了治妇科病的医生；路过洛阳时，闻知周人对老人恭敬，就做了专治耳、眼、四肢痹病的医生；到咸阳来，听说秦人喜爱孩子，就做了治小儿病的医生；他随着各地的习俗来变化他的行医范围。秦国的太医令李醯知道自己的医术不如扁鹊，就派人刺杀了扁鹊。到现在，天下谈论脉学的人，都还是遵从扁鹊的理论和实践。
太仓公是在齐国都城管理粮仓的官员，他是临淄人，姓淳于，名意。年少的时候喜好医术。汉吕后八年，又拜了同郡元里的公乘阳庆为师学习医术。这时阳庆已有七十多岁了，没有后代，就让淳于意把他从前学的医方统统丢掉，然后把自己的秘方全交给他了，并传授给他黄帝、扁鹊的脉书，教给他通过观察面部不同颜色来治病的方法，使他能预知病人的生死，决断疑难杂症，判断可否治疗，还教给他药剂的理论，都非常精辟。淳于意学了三年后，为人治病，预断死生，很多都能应验。然而他到各诸侯国去行医、游学时，不拿齐国的家当家，有时又不肯替人治病，因此有许多病人怨恨他。
孝文帝四年，有人上书控告他，按照刑律论罪，要用传车将其押解到长安。淳于意有五个女儿，跟在他的后面哭泣。他发怒而后骂道：“生孩子不生男孩，结果到紧要关头时就没有能派上用场的人！”当时最小的女儿缇萦听到了父亲的话后很感伤，就跟随父亲西行去了长安。她上书朝廷道：“我父亲做官，齐国人都称赞他的清廉公正，现在他犯法被判刑。我非常痛心受刑死去的人不能再生，受刑致残的人也无法复原，即便想要改过自新，也无路可走，终究不能如愿。我情愿进官府做奴婢，来为父亲赎罪，希望能给父亲争取一个改过自新的机会。”孝文帝看到缇萦的上书后，怜悯她的心意于是赦免了淳于意，并且于这一年废除了肉刑。
淳于意回到家里，皇帝下诏问他在所治疗的病例中，决断死生的有多少人灵验，他们都叫什么名字。诏书中问前太仓淳于意：“有什么专长的医术？能治什么病？有没有医书？都是从哪里学到的？学了几年？曾治愈哪些人？他们是哪里人？得的什么病？医治用药之后，病情怎样？全部详细作答。”淳于意答道：“我年轻的时候，就喜好医药的学问，用学到的医术试着给人看病，大多没有应验。到了吕后八年，我有机会拜临淄元里的公乘阳庆为师。当时阳庆七十多岁，我得到侍奉他的机会。他对我说：‘把你以前学过的医书全部丢掉，那些都不对。我有古代先辈医家传下来的黄帝、扁鹊的诊脉书，以及通过观察面部不同的颜色来诊病的方法，使你能预知病人的生死，决断疑难杂症，判定可否医治，还有论述药剂理论的书籍，都非常精当。我家中富足，只因我打心底里喜欢你，才想要把自己收藏的所有秘方和书全交给你。’我说：‘我太荣幸了，这些不是我所敢奢望的。’说完我就离开座席，再次拜谢了老师。我学了他传授的脉书上下经、脸色诊病术、听诊术、揆度阴阳外变术、医药理论、砭石神术、接阴阳等秘书和医术，在学习的过程中注意解析、体验，这样用了大约一年的时间。第二年，我试着行医，虽有效，还不够精妙。我跟着我的老师学习三年，就已经为人看病决断生死，都很灵验，已达到精妙的程度。现在阳庆已经死了十多年，我跟着他学了三年，现在我三十九岁了。”