辟谷期间由于不进五谷，身体需要一个适应阶段，会表现出一些不适。例如身体内部常有一种无法名状的不适，表现为浑身无力、四肢乏力、中气不足、迷糊昏沉，偶尔有眼花或头晕感，个别人还会发现眼前突然发黑等现象。
这段时间还会因为毒素的外排而表现为气色不佳、脸色灰暗、脸色青淡无血色，身上带有异味，口中常常发干、发臭或发苦（这种现象夏天特别明显），小便常短，发黄甚至发赤，大便溏稀或没有。冬天则会出现手脚发凉甚至发冰、身体怕冷等现象。但都是短暂的，一旦身体适应了辟谷的状态，身体会越发轻松，越发舒适。
