在当地爱国僧侣群众的协助下，人民解放军迅速摧毁了叛乱集团在拉萨的指挥中心，至3月22日，拉萨的武装叛匪被全部歼灭。从4月上旬开始，人民解放军分多路向山南地区开进。人民解放军在藏族同胞的引导下进剿叛乱武装在解放军强大的攻势面前，叛匪惊慌失措，四处逃窜。平叛部队迅速控制了整个山南地区，切断了叛乱集团与国外的联系。接着，又组织了纳木湖、麦地卡等战役，歼灭了青藏、川藏公路两侧的叛匪，保证了公路运输的安全。此外，还在昌都地区组织了两次战役，控制了金沙江、澜沧江两江之间的广大地区。到1959年11月，除少数叛乱分子逃往国外，叛乱集团的主要力量被歼灭。1961年底，平叛作战胜利结束。
