其实多尔衮并没有放弃对帝位的追求，对天地立誓，是很庄严的仪式，大多数人会信守誓言，可是有些口是心非的人只是做做样子而已，他们根本就没有打算共同辅助小皇帝。
盟誓结束后不久，代善的子孙硕托和阿达礼就开始了秘密活动，希望能把多尔衮推上帝位。多尔衮虽然并没有明确表态，其实就是表示了一种默许，他也是在对硕托、阿达礼的这一谋反行为心里存着侥幸。硕托、阿达礼知道礼亲王代善的态度举足轻重，就以探访的名义来到礼亲王府对代善说，不应该立一个毛头小儿为皇帝，应该另立他人。
在代善的观念里，既然已经拥立皇九子为皇帝，他就是合法的。如果再立他人，就是一种祸国乱政的事情。为了避免自己的子孙在这条邪路上越走越远，他开始派人监视硕托和阿达礼，并质问多尔衮。多尔衮害怕自己的行径暴露，害怕硕托、阿达礼说出一些对他不利的言辞，于是雷厉风行地采取了行动。他派人连夜将硕托、阿达礼提起来，以谋逆罪处斩，其他知情人也都一起被斩首。这样一来，他不仅摆脱了谋逆的嫌疑，而且还成为拥护新皇帝的功臣，使自己的权威更加强化。这件事只有极少数几个人知情，其中包括庄妃，这也给她敲响了警钟。
风波平息后，在清崇德八年（1643年）八月二十六日，庄妃六岁的儿子福临被送上了皇帝的宝座。皇帝即位的盛典在大殿正式举行，改年号为顺治元年，由叔父睿亲王多尔衮、叔父郑亲王济尔哈朗共同辅助政事。
这一天天气很寒冷，侍臣给顺治进了一件貂裘衣，被他拒绝。乳母担心他年幼，想跟他一同乘车，顺治却告诉她，这不是你适宜乘坐的车，不可以一同乘坐。这件事显示出了他不可侵犯的帝王的尊严，这与庄妃对他从小的训练和调教是分不开的。
福临即位后，立即尊封母后为母后皇太后，尊封生母为圣母皇太后，从此两宫的皇太后共同辅助幼小的皇帝，这在历史上是首次出现的。
顺治成为了一国之君，但是由于他年纪太小，仍然与母亲庄妃住在永福宫中。在庄妃的教导下，顺治打下了坚实的文化底子，在母亲的鼓励下，他还像满洲少年一样，对骑马打猎也很有兴趣。在他的父亲皇太极还在世的时候，曾经带他去叶赫一带打猎，他就曾“射中一鹰”，当时的他只有五岁。