1938年，中国共产党派遣100多名干部参加盛世才政府的工作，其中27人在教育战线工作，一些人在教育行政部门担任领导职务，从省教育厅长到科员都有共产党员的身影。一些人担任学校领导职务或教学工作，着名民主人士杜重远担任新疆学院院长后，邀请全国着名学者沈雁冰、张仲实、沈志远、高滔、涂治等来新疆讲学，中国共产党人和民主人士通力合作，团结各民族教育工作者，为发展新疆教育事业，做了许多开拓性的工作。第一，健全省、区、县教育行政机构。省教育厅设立编译委员会、社会教育科和督学室；专区教育局增设社会教育科和督学，县设立教育科。把专区以下的教育权力集中到专区教育局，加强对各类公立、会立学校的领导和监督。第二，增加教育经费并动员社会力量办学。在财政厅厅长毛泽民的支持下，教育经费逐年增加，第二期三年计划中，教育经费总预算，较第一期三年计划中教育经费支出增加161%，占全部预算的11.5%，这个比例在当时全国来说是很高的。除了上述措施还继续动员社会各界捐资办学。第三，建立规章制度，稳定教学秩序。教育厅制定了普通教育和社会教育的各项规程和实施细则，保证了教学工作的有序进行。第四，培训师资，加强教师队伍建设。经过努力，到1942年小学教师已达6000余名，从1938年起对教师实行“年功加俸”，提高教师的积极性。第五，编译出版各科小学教材，据不完全统计，从1939年到1941年，新疆共出版维吾尔、哈萨克、蒙古、汉四种文字的课本65万册，使各族儿童有书可读。第六，重视社会教育。成立民众学校，开展扫盲和业余小学教育。民国二十七年（1938年）有民众学校143所，学生6423人；至1942年民众学校达846所，学生146911人。这一系列有力措施，进一步促进了新疆教育事业的发展，到1942年全疆公立、会立小学共2463所，学生271100人，比1937年增长1.4倍；大中学校8所，学生3787人，比1937年增长27.5%。民国二十九年还办起幼儿园1所，在园幼儿153名，这是新疆幼儿教育的开端。
还有一个与以上数据近似的统计数字，统计得更为详细。新疆有大中学校1所（指新疆学院及其附属高中），学生250人，其中汉族164人，满族2人，回族3人，维吾尔族52人，锡伯族5人，哈萨克族7人，柯尔克孜族3人，塔塔尔族6人，塔兰其3人，乌孜别克族5人；中学5所，学生2301人，其中汉族1083人，维吾尔族235人，满族14人，蒙古族30人，回族65人，锡伯族78人，索伦（达斡尔族）16人，哈萨克族263人，柯尔克孜族7人，归化族（俄罗斯）229人，塔塔尔族92人，塔兰其111人，塔吉克族1人，乌孜别克族77人；师范1所，学生865人，其中汉族247人，维吾尔族331人，满族24人，蒙古族21人，回族32人，锡伯族9人，哈萨克族132人，柯尔克孜族11人，塔塔尔族6人，塔兰其21人，乌孜别克族6人；简师1所，学生150人，全部是维吾尔族学生；教训班3所，学生310人，其中汉族24人，蒙古族20人，回族7人，维吾尔族219人，哈萨克族30人，归化族2人；公立学校（小学）580所，学生91065人，其中汉族22376人，满族352人，蒙古族3425人，回族5463人，维吾尔族36308人，锡伯族1143人，索伦族627人，哈萨克族10865人，柯尔克孜族1424人，归化族4660人，塔塔尔族750人，塔兰其2495人，塔吉克族228人，乌孜别克族949人；会立学校（小学）1883所，学生180035人，其中汉族338人，蒙古族130人，回族417人，维吾尔族162677人，哈萨克族14981人，锡伯族428人，柯尔克孜族1048人，归化族16人；全疆总共有学校2474所，学生总计274976人，其中维吾尔族199972人，汉族24250人，哈萨克族26298人，满族392人，蒙古族3616人，回族5987人，锡伯族1663人，索伦族643人，柯尔克孜族2493人，归化族4907人，塔塔尔族853人，塔兰其2636人，塔吉克族229人，乌孜别克族1037人。通过以上数据我们可以看到，当时新疆13个世居民族的教育均有较大的发展，特别是维吾尔族教育发展更快些，如果把清代到伊犁回屯的维吾尔人（塔兰其）受教育人数加到维吾尔族之中，那么，维吾尔族学生总数为202608人，占全疆学生总数的73.68%。
实事求是地说，虽然这一时期教育发展较快，但因过去基础太差，新疆教育落后的面貌没有根本改变。
（四）国民党直接统治时期的新疆教育
国民党直接统治时期，教育不仅没有多大发展，而且有些方面还发生倒退，显得更落后。这一时期宗教对教育的干预加强，在公立会立学校以外，存在大量的经文学校。在南疆，宗教学校的数字是庞大的，现列举1949年6个县的数字如下：
从上表可以看出，宗教学校的数目比普通学校的数目多19%，学生人数也约占普通学校学生数的1/5强。1944年以前，南疆各地公立、会立学校高小课程里每周有1小时的经文课，初小没有，课本由教育厅印发，教员由学校聘请。自国民党直接统治新疆以来，各地阿訇干涉教育，每所学校无论高初级学生每周都有6小时的经文课，经文教员由阿訇指派，材料由阿訇任意教授。
据统计，新中国成立前夕，新疆只有一所规模很小的高等学校（新疆学院），学生379人（其中少数民族185人），教师36人（少数民族14人）；有中等专业学校11所，学生1975人（少数民族1266人），教师134人（少数民族76人）；中学9所，学生2925人（少数民族1819人），教师172人（少数民族94人）；小学1335所，学生197850人（少数民族182427人），教师7705人（少数民族6799人）。那时，绝大多数青少年得不到入学机会，学龄儿童入学率只有19.8%，目不识丁者占青少年总数的90%以上。
二、新中国成立以来新疆教育事业的发展历程
新中国的成立，开启了新疆社会主义教育事业发展的新阶级，然而，发展的道路是不平坦的，经历过曲折和失误，中共十一届三中全会后，才真正走上了健康、快速发展的道路。
（一）新疆社会主义教育事业的初创时期
从中华人民共和国建立到1956年年底，可以说是彻底改造旧教育，初步建立社会主义教育制度的阶段。《中国人民政治协商会议共同纲领》明确规定：
“人民政府应有计划有步骤地改革旧的教育制度、教育内容和教育方法。”1950年3月26日，新疆省人民政府发布《关于目前新疆教育改革的指示》指出：
“现在反动的国民党统治已被打倒了，人民已做了主人，在这新时代教育是属于人民的，为大众服务的，因此，应有计划有步骤地来改革其教育制度、教育方法和课程内容，使其满足人民大众利益和建设新社会的需要。”当时对中小学教育进行了重大改革：
一是取消毒化学生的教育方针和制度。新中国的教育制度是教育必须为劳动人民服务，学校必须向工人农民及其子女开门，必须彻底摒弃那种只为少数人办学的旧教育思想。重视思想教育，培养为人民服务的思想，改正轻视劳动与劳动人民的旧观点和旧思想，养成实事求是、艰苦朴素、认真学习、自我批评、自动自治、互助友爱、遵守纪律的新作风。树立爱祖国、爱人民、爱劳动、爱科学、爱护公共财物的新公德。反对思想统治与消极处罚和变相体罚，提倡自由思想、民主讨论、耐心说服的新教育方法。
二是逐步进行课程改革。凡带有反共反人民毒素的科目和教材，各校需立即停授，在中学停授公民、伦理、童训、军训；在小学要停授公民、军训及宗教课程。改革后，各级学校应采用人民政府审定的教材，如果课本未能完全印就或未运到之前，自然科学（包括数、理、化、动植物、自然常识）可选择较好的旧课本使用，但必须去掉不切合实际的内容。国文、历史、政治常识（有关思想教育部分）可暂从新出版之书报或《新疆日报》上选材（由教育厅统一指定）。少数民族学生教材语种多，编写、印刷是一大难题。所以新中国成立初期，新疆维吾尔、哈萨克、乌孜别克、俄罗斯、柯尔克孜、塔吉克、塔塔尔等7个民族使用苏联教材。如果从三区革命时三区学校用苏联教材算起，使用苏联教材有10多年时间，苏联课本讲的是“我们的祖国是苏联”“首都是莫斯科”，从小没有很好培养对中华人民共和国的认同感。这是一个深刻的教训，1962年“伊塔事件”后，党和政府才认识到这一点。
三是接管新盟管理的学校。新疆和平解放后，新疆人民民主同盟接办了各区县会立小学247所，孤儿学校11所，由该会所收宗教税“乌守尔、扎卡提”充作教育经费，保证了十万余儿童入学，对新疆文教事业的恢复和发展起了重要作用。但是，到了1951年由于农村减租反霸运动的深入展开，农民觉悟提高了，不愿意再交宗教税，租种瓦合甫宗教土地的农民要减租，致使新盟经费来源大为减少，负担不了会立学校的经费，因此，于1951年11月30日呈请省政府，建议会立学校由政府接办。省人民政府第65次会议讨论决定接管新盟会立学校，自1952年1月1日起，会立小学校247所，2224班，103782名小学生，即由当地政府接办。并对一些学校进行合并和调整。
四是取缔经文学校，并取消经文课，禁止对学生进行宗教宣传。当时没有明文规定取缔经文学校，而是在《目前新疆教育改革的指示》中规定：对私立各级学校，一律采取保护和帮助逐步改造的方针，但必须执行新民主主义教育方针与人民政府的法令，不得将宗教科目列为必修，在课内不能进行宗教宣传，不能强迫学生信教和参加宗教仪式。这个规定是正确的，也很策略。此后，南疆的经文学校大为减少。1952年中共中央新疆分局二届党代会错误批判王震后，宗教人士纷纷要求发展经文学校和恢复公立学校宗教课，在当时的气氛下，政府作了让步。1952年11月23日，教育厅发出《关于宗教小学及宗教课程问题的指示》，指出，宗教小学是宗教界自己办的小学，不应由政府代为设置，也不应由政府拨给经费。政府鼓励与帮助经文小学增加一些文化课，公立小学每周保留两小时经文课时间，讲授与否由当地人民自行决定，但对不愿学经文的学生不能强迫。经文小学与公立小学经文课的讲授不得违背共同纲领、民族团结、爱国主义与国际主义的原则。此后，南疆经文学校有较大发展。1958年又明令取消经文学校和经文课，以后又有反复。
这个问题是民族教育中必须处理好的重大问题。
五是重点发展民族教育。发展民族教育关键是培养少数民族师资，1952年，为了有计划培养民族教师，动员几百名少数民族初高中毕业生入新疆民族学院（后又改为新疆学院）学习，毕业后做少数民族教师；同时从中小学抽调1200名少数民族教师到分局干校培训一年。1953年，在迪化建立蒙古师范学校，首批招生150名。1954年，在塔什库尔干设立了1所由政府供给食宿的塔吉克族完全小学；在喀什师范和阿克苏中学分别为柯尔克孜族设立了师范班和中学班。1956年，在克孜勒苏柯尔克孜自治州首府阿图什为柯尔克孜族新建中学1所。
截至1956年底，新疆高等学校由1所增加到5所，在校学生由1949年的379人增加到3445人，专任教师由36人增加到833人；普通中学由9所增加到95所，在校学生由2925人增加到47619人，专任教师由172人增加到1744人；小学由1335所增加到2145所，在校学生由19.97万人增加到45.67万人，专任教师由7705人增加到12994人。1956年，大学生中少数民族学生占61.31%；中学生中少数民族学生占83.77%；小学生中少数民族学生占86.69%。学龄儿童入学率由1949年的19.8%，上升到1956年的46.9%。特别要指出的是，经过土地改革，广大贫苦农民翻了身，他们的子女有了上学读书的权利，据1955年的调查，在小学生中工农子弟已占80%左右。还有一个显着特点是女生的比例上升，小学生中女生比例由1949年的28.3%上升到1956年的48.83%；中学生由1949年的23.56%，1956年上升到38.79%。这一时期新疆教育的发展是健康的、稳妥的。