孔温窟哇有五个儿子，木华黎（？～1223）是他第三个儿子。据说，木华黎出生时有白色的气弥漫于帐中，神巫非常惊异，说：“这是一个非同寻常的孩子。”他长大以后，性格沉稳坚毅，足智多谋，长了一双猿猴般的长臂，擅长射箭，能挽二石的强弓。
约在1197年，孔温窟哇把木华黎和另一个儿子不合选给成吉思汗做“梯己奴隶”。成吉思汗曾经作战失利，正赶上天降大雪，迷失了军。
帐所在地，夜里躺在草丛中。木华黎与博尔术站立在雪地中，张开毛毡，为成吉思汗遮蔽风雪，一直到天亮始终一动不动。一天，成吉思汗率30余名骑兵行走于山谷之间，回头对木华黎说：“此地如果遇到强盗，应当怎么办？”木华黎答道：“请让我用身体来挡住他们。”一会儿，强盗果然从树林中突然杀出，箭如雨下，木华黎弯弓搭箭，三箭射中三个人。强盗头高声叫道：“你是谁？”回答道：“木华黎。”木华黎慢慢地解下马鞍持在手中，护卫着成吉思汗的身体冲出树林，强盗们也退去。
克烈王可汗与乃蛮部相互仇杀交战，向成吉思汗求援。成吉思汗派木华黎和博尔术等人去援救他，在按台之下杀死了全部乃蛮的人马，缴获了甲仗、马牛而返人河东，攻打太原、忻、代、泽、潞、汾、霍等州，全部降服了他们。于是攻占平阳，金国守臣弃城逃走，木华黎任命前锋拓拔按察儿统领蒙古军镇守该城以抵御金兵，任命义州监军李廷植的弟弟李守忠代理河东南路帅府事。1219年，命令萧特末儿等人率部出云州、朔州，进攻并降服了岢岚火山军。任命谷里夹打为元帅达鲁花赤，攻打并拔除了石、隰州，进击绛州，将其攻克。
1220年，率军再次从燕州进军攻取赵州（今河北赵州），进驻满城（今属河北）。武仙率真定府投降。代理河北西路兵马事的史天倪进言说：“目前中原已经大致上得到平定，但是我军所过之处，无不纵兵抢掠，这不是君王抚慰人民的本意。”木华黎认为此话在理，于是下令严禁抢劫掠夺，所俘获的男女老少，一律遣还故里，军中从此肃然有序，各地的官吏和百姓非常欢喜。进军至滏阳，金国邢州节度使武贵前来投降，进兵攻打天平寨，攻破了它。这时，蒙古不花一军又攻下河北的卫、怀、孟州，进入济南，严实带着所属的30万军民，前来军营投降。
当时，金兵屯守在黄陵冈，号称20万人马，派遣步兵2万人袭击济南。木华黎率轻装士兵五百击退了他们。于是会合大部队，迫近黄陵冈，金兵在黄河南岸布下阵势，以示决一死战。木华黎说：“这次战斗不能使用长武器，应当用短小的武器才会取胜。”下令骑兵下马，把弓拉满一齐放箭，自己也下马督战，果然大败敌军，淹死了许多人。
继而进攻楚丘。楚丘城池虽小却十分坚固，四面都是水，木华黎命令各军用草木填塞壕沟，直抵城下。严实率所部将士首先登上城墙，回。不久，王可汗阴谋袭击成吉思汗，他的部下拔台得知此事，秘密地报告了成吉思汗。成吉思汗派木华黎挑选精锐的骑兵夜里冲进王可汗的营地大砍大杀，王可汗逃走后死亡，各部落的头领们闻风而降。
1206年，铁木真称成吉思汗，第一件事就是任命木华黎、博尔术为左右万户。成吉思汗从容安、详地对他们说：“国内得以平定，你们出力最多。我同你们就好像车有辕、身体有胳膊一样，你们一定要深切体会这一点，不要改变当初的心念。”
金国投降过来的人，都说他们的皇帝杀戮宗室亲属，荒淫无道且日甚一日。成吉思汗说：“我出兵有了正当的名义了。”1211年木华黎跟从成吉思汗讨伐金国，直逼宣德，于是攻克德兴。1212年，进攻云中、九原诸郡，一一攻克。进军包围抚州。金兵号称40万人马，在野狐岭（今河北万全北）北面摆好阵势。木华黎说：“他们人多我军人少，不拼力死战，就不会轻易地击败他们。”于是率领敢死队员，跃马横枪，大声呼叫着冲人敌阵。成吉思汗指挥各军一起进攻，大败金兵，追杀至浍河，长达100里的道路上布满了僵硬的敌尸。1213年，木华黎率军攻打居庸关，该关城墙坚固，无法攻人，于是派遣兵马直奔紫荆口，金国左监军高琪领兵前来拒战，不战而逃，于是拔下涿州。又分兵攻克了益都、滨、棣等城，部队进驻霸州，史天倪、萧勃迭率部下前来投降，木华黎上奏成吉思汗，两人一起被任命为万户。
1217年八月，成吉思汗下诏封木华黎为太师、国王、都行省承制行事，赐予他誓券、黄金印说：“你的封国由子孙相传。世世代代永不断绝。”又把弘吉剌、亦乞烈思、兀鲁兀、忙兀等十支部队以及吾也而的契丹、蕃、汉等部队，一并归他指挥。并且告诉他说：“太行山北面，我自己筹划治理，太行山以南，你好自为之吧。”又把自己出行时车驾所用的九脾大旗赐给木华黎，并告知诸将说：“木华黎建此旗发出的号令，就像我亲临到场时发出的号令一样。”于是木华黎就在云、燕建立行省，以图进取中原。随后从燕州南端进攻遂城及蠡州诸城，逐一攻破。冬天，攻克大名府（今河北大名），在东面平定了益都、淄、登、莱、潍、密等州。
1218年，率军从西京出发经由太和岭进攻克了该城。接着攻下单州，包围东平，木华黎任命严实代理山东西路行省，自身北还，进临行前告诫他说：“东平城中的粮食吃尽，敌军一定弃城逃走，你等待他们离去，立即进城安抚百姓，千万不要使郡县受苦，以免坏了大事。”同时留下梭鲁忽秃率蒙古军3000人屯守。1221年四月，东平的粮食吃尽，金国行省长官忙古逃奔汴京，梭鲁忽秃半路狙击他，斩首7000余级，忙古仅率数百名骑兵逃去。严实进入东平城，建置行省，安抚当地人民。
1222年，木华黎攻拔荣州（今河津西南），占有河中府，派石天应守此军事要害。接着，大军渡河西进，直趋长安。当时，中条山的盗贼侯七等人聚众十余万，探知木华黎的大部队已经西进，便阴谋袭击河中。石天应派别将吴权府率500名士兵夜里出东门，埋伏在两条山谷之间，告诫他说：“等贼军过去一半，赶紧出击，我在他们的前面，你攻打他们的后面，这样就可以打败他们。”吴权府喝醉了酒没有按时到达，石天应战死。城被攻陷，贼军烧毁屋舍，杀戮抢掠人民，退回中条山。先锋元帅按察儿在途中阻击，打败了贼军，斩首数万级，侯七再次逃去。木华黎下令石天应的儿子斡可继续统领他的部下。
1223年春，部队返回，但浮桥尚未建成，木华黎回头对众将领说：“桥还没有完工，难道能坐着等待吗？”于是又攻下了十余个河西一带的堡寨。三月，木华黎渡过黄河回到闻喜县（今属山西），病情加重，对他的弟弟带孙说：“我为国家建立了伟大的功业，身穿铠甲，手执武器将近四十年，东征西讨，没有什么可遗恨的，只恨汴京还未攻下！
你要努力啊。”说完便去世了，终年54岁。
后来成吉思汗亲自攻打凤翔，对诸将说：“要是木华黎在世，我就用不着亲临此地了！”