九卿是我国古代中央政府机构和官员的合称。
九卿在夏朝即已出现，《礼记》记载：“夏后氏官百，天子有三公、九卿、二十七大夫、八十一元士。”
周朝时，以少师、少傅、少保、冢宰、司徒、宗伯、司马、司寇、司空为九卿，前三卿专辅天子，后六卿分管政务，按其次序，相当于后来的吏、户、礼、兵、刑、工六部尚书。
战国时期，一般以中央政务机关之首长为卿。秦以奉常（主管礼仪祭祀）、郎中令（主管宫外警卫）、卫尉（主管宫内警卫）、太仆（主管车马）、廷尉（主管刑狱）、典客（主管内外客使）、宗正（主管皇族谱籍）、冶粟内史（主管盐铁钱谷）、少府（主管皇帝财产）等机关首长为九卿。
汉承秦制，只是将奉常改为太常、郎中令改为光禄勋、典客改为大鸿胪、治粟内史改为大司农。秦汉九卿，隶属宰相，在其指挥下负责执行政务，且参与朝议，职权较重。
东汉时九卿分属三司（太常、光禄勋、卫尉三卿并太尉所部；太仆、廷尉、大鸿胪三卿并司徒所部；宗正、大司农、少府三卿并司空所部），多进为三公，各有署曹掾史，随事为员。
魏晋南北朝大体沿汉制，梁时曾增设机关，置十二卿，虽然增加了太府、大匠、太舟三卿，但仍以旧九卿为骨干。北齐改廷尉为大理，少府为太府，合太常、光禄、卫尉、宗正、太仆、鸿胪、司农，称之为九寺；置卿、少卿、丞各一人，各有功曹、五官、主簿、录事等员。自古“九卿”同“九寺”，但正式将“九寺”与官职连用则始于北齐。
隋唐九寺与北齐相同，宋因避太宗赵光义讳，将光禄寺改为崇禄寺，其余和唐同。隋唐宋时，因六部执行政务，九寺（九卿）仅为中央办事机构的长官，且要受六部的指导。
明代九卿有大小之分，一般以六部尚书和都察院都御史（主管监察）、通政司使（主管奏章）、大理寺卿为大九卿；以太常、光禄、太仆、鸿胪、苑马（主管御马）、尚宝（主管印玺）六机关首长和詹事府詹事、翰林院学士、国子监祭酒为小九卿。
清代则不把六部列入大九卿，除都察院、大理寺、通政司之外，其余具体指某官并无明文规定。而小九卿则一般为宗人、太常、太仆、光禄、鸿胪五机关首长、詹事府詹事、国子监祭酒、顺天府尹、左右春坊庶子。